La serie è ambientata nell’immaginaria città giapponese di Sugomori, costruita su un terreno bonificato e che da anni ha la sua popolazione in diminuzione. Il liceale Katsuhira Agata viene invitato dalla misteriosa compagna di classe Noriko Sonosaki nel “Kizuna System”, un sistema incompleto per la realizzazione della pace mondiale che permette alle persone connesse dette “Kiznaiver” di condividere le proprie ferite e il dolore con altri Kiznaiver.